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2025 EMQN最佳实践指南:实体肿瘤微卫星不稳定性的分析与报道
发布日期:
2025-08-20
英文标题:
EMQN best practice guidelines for analysis and reporting of microsatellite instability in solid tumours
制定者:
欧洲分子基因诊断质量联盟
出处:
Eur J Hum Genet .2025 Aug 20.
AI大纲:
微卫星不稳定性(MSI)概述
定义:短串联重复DNA序列(微卫星)中插入和缺失变异的积累
与MMR的关系:DNA错配修复系统(MMR)功能丧失后出现高水平MSI
临床意义:与化疗耐药、免疫检查点阻断反应相关,是林奇综合征(LS)的生物标志物
指南目的
为评估实体瘤MMR状态的MSI分析提供最新建议
明确术语并回顾常见方法
引言
错配修复系统(MMR)的组成与功能
错配修复缺陷(dMMR)的临床意义
微卫星不稳定性(MSI)检测的目的与范围
方法
指南制定的必要性
工作组的组成与会议安排
文献回顾与讨论要点
推荐等级的定义
社区咨询与指南修订
术语与常见MSI分析方法
术语
MSI-H:指示dMMR,样本可描述为微卫星不稳定或MSI阳性
MSS:无微卫星插入缺失变异,指示pMMR,样本可描述为MSI阴性
MSI-L:片段长度分析检测到的微卫星插入缺失变异适度增加,通常指示pMMR
MSI-I:测序分析中用于表示结果不确定
dMMR/pMMR:可用于描述MSI分析或其他评估MMR功能方法的结果
常见分析方法
片段长度分析(FLA):通过电泳分离PCR扩增的微卫星片段,检测插入缺失变异。需专家解释,常需匹配正常DNA;原理与发展、分类标准、优缺点
测序分析:利用下一代测序数据,通过多种算法量化MSI。需专业实验室和计算基础设施,可并行分析其他遗传标记;方法多样性、分类阈值、优缺点
高分辨率熔解曲线分析(HRM):利用PCR扩增子熔解特性变化检测微卫星插入缺失变异。成本与FLA相似,分析自动化;通过PCR扩增子熔解特性变化检测微卫星插入缺失变异,使用双链DNA结合荧光团评估DNA熔解,将扩增子熔解曲线与MSS样本参考进行比较,分析单核苷酸重复MSI标记,可在同一管中跟随PCR且自动化,每个样本操作和运行时间<3小时,可扩展性受批量大小限制
免疫组织化学(IHC):可视化MMR蛋白表达,是dMMR的高度敏感和特异生物标志物。需专家病理学家解释,与MSI分析有一定不一致性;可视化肿瘤组织中MMR蛋白表达,一种或多种蛋白染色缺失指示dMMR,广泛可用,周转时间快,需要专家病理学家进行结果解释,与MSI分析结果存在一些不一致性
MSI分析方法学与验证建议
评估MSI标记的种系变异,分析多态性标记时需匹配正常DNA
仅使用单核苷酸重复进行MSI分析,分析其他类型重复需报告例外情况
使用多个MSI标记面板,最少使用5个标记
针对每种肿瘤类型分别验证MSI检测方法,非胃肠道肿瘤使用IHC作为参考方法
验证MSI检测时不使用肿瘤突变负荷和突变特征作为参考方法
解决MSI检测与其他dMMR检测结果不一致的问题
为新的实验室开发测试选择合适的MSI标记
评估MSI标记的种系变异时考虑种族差异,分析多态性标记时需匹配正常DNA以排除种系变异,需报告例外情况
仅使用单核苷酸重复进行MSI分析以避免对MSH6缺陷的敏感性降低,需报告例外情况
使用多个MSI标记面板,最少使用5个以最大限度减少种系变异和随机体细胞突变的影响,需报告例外情况
针对每种肿瘤类型分别验证MSI分析方法,非胃肠道肿瘤使用IHC作为参考方法,需报告例外情况
不使用肿瘤突变负荷和突变特征作为MSI检测验证的参考方法
通过独立方法解决MSI检测与其他dMMR检测结果的不一致问题
不为新技术假设不同检测的MSI标记具有等效的敏感性和特异性,为所用技术选择标记
MSI分析结果报告建议
报告未遵循建议时的方法局限性和临床解释影响
报告样本的肿瘤细胞含量和替代组织学情况及临床解释影响
报告结直肠癌和子宫内膜癌MSS/MSI-H结果时说明林奇综合征诊断可能性
可在报告中包括MSI-H结直肠癌和子宫内膜癌的额外检测结果以支持LS诊断可能性的解释
报告MSI分析结果的局限性
报告样本的肿瘤细胞含量和替代组织学
报告结直肠癌和子宫内膜癌的林奇综合征诊断可能性
报告其他癌症的林奇综合征诊断可能性
报告任何癌症对免疫检查点抑制剂治疗的反应可能性
不将MSI-L/MSI-I结果解释为MMR功能或反应的证据
如有可用,报告MMR免疫组化结果以辅助解释MSI分析结果
当不遵循建议1-4时在报告中包含 caveats,具体说明局限性和临床意义
在报告中评论肿瘤细胞含量、替代组织学及其临床意义,肿瘤细胞含量不足时请求新样本或探索替代dMMR检测
为结直肠癌和子宫内膜癌的MSS/MSI-H结果包含林奇综合征诊断可能性的陈述
可为MSI-H结直肠癌和子宫内膜癌包含额外检测(如BRAF、MLH1启动子高甲基化)的激活或结果以支持林奇综合征可能性解释
可为非结直肠、非子宫内膜癌的MSS/MSI-H结果包含林奇综合征诊断可能性的陈述(考虑相关指南)
为任何癌症的MSS/MSI-H结果包含对免疫检查点抑制剂治疗反应可能性的陈述(考虑相关指南)
不将MSI-L/MSI-I结果解释为MMR功能/缺陷或对ICI治疗反应的证据,可解释为增加林奇综合征诊断的可能性
如相关且可用,在报告中包含MMR IHC结果以辅助MSI分析结果解释
讨论
指南的目的与重点
推荐的技术优势
报告指南的临床关联
LS筛查的重点肿瘤类型
dMMR的其他临床意义
推荐总结
推荐内容总结于表1
提供诊断和报告工作流程(图4)
指南概述
常见术语和方法概述
15条最佳实践推荐
推荐目的
减轻不同MSI分析方法的主要技术限制
具体推荐内容
推荐使用单核苷酸重复MSI标记物组合检测MSH6缺陷肿瘤的MSI,与近期ESMO指南一致
非胃肠道肿瘤的MSI分析方法应根据MMR IHC进行验证,与近期CAP/ASCO指南一致
报告指南
关注dMMR癌症的两个临床关联:ICI治疗反应和LS风险
LS筛查推荐
聚焦结直肠癌和子宫内膜癌
其他注意事项
dMMR在特定肿瘤类型中可能有其他临床意义,本指南未讨论
其他信息
致谢
作者贡献
资金来源
利益冲突
伦理批准
通信与材料请求
版权信息
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评论
提交评论
1099767
2025.08.22
回复
指南指南,我要多看指南
/ 没有更多了 /
上传者信息
黑加仑
于2025-08-21上传
编者信息
欧洲分子基因诊断质量联盟
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